Слово «капитан-лейтенант-инженер» правильно пишется как «капитан-лейтенант-инженер», с ударениями на гласные - а (3-ий слог), а (6-ой слог), е (9-ый слог).
Чтобы найти приставку в слове, надо подобрать однокоренное слово без приставки или с другой приставкой. Каждая приставка имеет своё значение и уточняет значение слова.